（一）党政办公室。负责机关日常运转，承担文秘、督查、安全、保密、信访、政务公开、考评，协调后勤服务管理等工作。组织指导卫生健康工作领域的国际交流与合作、对外宣传、援外工作，承担机关和所属单位外事管理工作。牵头组织拟订卫生健康事业中长期发展规划，卫生健康规划的编制和实施。承担卫生健康领域综合性政策调研，研究提出有关政策建议。承担规范性文件的合法性审查工作，承办行政应诉等工作。负责机关和指导所属单位党建、党风廉政建设、意识形态及群团工作，指导全县公立医院党建工作，管理县级卫生健康行业党组织。承担新闻宣传、舆情监测和信息报送、发布等工作。
（二）人事与科技教育股。拟订卫生健康人才发展政策措施及规划并组织实施，统筹协调全县卫生健康人才队伍建设。承担机关和所属单位的人事管理、工资管理、机构编制和队伍建设等工作。负责卫生健康专业技术人员资格管理。负责机关离退休人员工作，指导所属单位离退休人员工作。贯彻落实国家、省、市卫生健康科技发展规划及有关政策并组织实施。组织开展毕业后医学教育和继续医学教育工作。协调实施卫生健康人员队伍岗位培训工作。
（三）规划财务与健康产业股。承担机关和预算管理单位预决算、财务、资产管理、内部审计等工作。指导、监督卫生健康相关经费的管理使用。统筹规划与协调卫生健康资源配置工作，管理配置大型医用装备。组织实施卫生健康公共服务体系建设。协调医用设备、医用耗材招标工作。指导卫生健康服务体系及信息化建设。牵头组织施甸县大健康产业推进工作，负责组织拟定大健康产业发展规划、工作方案和工作计划等。协调促进大健康产业发展政策措施的落实。统筹医养结合、医体融合等健康政策。组织开展卫生健康统计工作。
（四）体制改革与基层卫生健康股。组织开展医疗卫生健康事业发展的政策研究工作，提出有关政策建议。承担深化医药卫生体制改革具体工作，研究提出深化医药卫生体制改革重大方针、政策、措施的建议，组织推进公立医院综合改革工作。拟订基层卫生健康政策措施及规划，并组织实施。指导基层医疗卫生健康服务体系建设和基层医疗卫生机构服务能力评价工作，指导推进乡村医生管理、家庭医生签约服务、基层基本公共卫生服务等工作，组织推进基层卫生综合改革。贯彻落实国家药物政策和国家基本药物制度，指导和监管各级医疗机构药品合理使用和基层医疗机构基本药物零差率销售。做好短缺药品监测预警工作。负责实施全县乡村振兴领域的卫生健康相关工作。
（五）医政与中医药综合管理股。指导并监督落实关于医疗机构及医务人员、医疗技术应用、医疗质量、医疗安全、医疗服务、行风建设等行业管理政策规范、标准。承担推进护理、康复事业发展工作。开展医院等级评审、平安医院建设、医疗纠纷处置有关工作。监督实施重大疾病政策规范。落实公立医院运行监管、绩效评价和考核制度。负责保健对象的医疗保健工作。承担相关重要会议、重大活动的医疗卫生保障工作。承担实验室生物安全管理工作。贯彻落实中医药法律法规，拟订全县中医医疗机构及人员、医疗服务、质量管理等政策措施，监督管理中医药规范和技术标准的实施。负责中医医院等级评审工作，指导其他医疗机构中医业务工作。参与拟订全县中医药事业发展、中医药防治重大疾病、中医药产业发展等规划和中医药医改政策措施，并组织实施。开展中医药师承等人才教育培养工作，承担中医药科普、文化宣传工作。组织开展中医药资源普查。承担其他综合性中医药服务协调管理工作。组织指导各类突发公共事件的医疗救治和紧急医学救援工作。指导和管理全县采供血工作。负责宣传、执行和监督检查卫生健康有关法律、法规、规章。负责全县卫生健康行政执法管理和监督工作。组织实施全县卫生健康“放管服”改革工作，落实行政审批制度改革任务。统一管理全县卫生健康行政审批工作，集中承担行政审批事项统一受理、审核、审批和发证，推进行政审批工作规范化、标准化、便民化。承担医疗卫生行业综合监管工作，查处医疗服务市场违法行为。承担公共卫生监督工作，组织指导开展环境卫生、公共场所卫生、饮用水卫生监督检查工作，依法组织查处公共卫生重大违法行为，完善全县卫生健康综合监督体系。
（六）妇幼与人口家庭发展股。拟订全县妇幼卫生健康规划和政策措施，监督落实国家妇幼健康服务标准、规范，推进妇幼健康服务体系建设，指导妇幼卫生、出生缺陷防治、婴幼儿早期发展、人类辅助生殖技术管理、产前诊断技术管理和生育技术服务工作。承担人口监测预警工作并提出人口与家庭发展有关政策建议，落实生育政策和计划生育特殊家庭扶助制度。落实托育工作牵头部门职责，发展普惠托育服务，提升托育供给水平。负责落实云南省计划生育协会安排的相关工作。组织拟订和协调推进医养结合政策落实，监督落实医养结合标准、规范，建立和完善老年健康服务体系。
（七）爱国卫生运动协调指导股。贯彻执行爱国卫生工作的法律法规和方针政策。组织开展爱国卫生运动，拟定全县巩固创建卫生城镇工作长期规划、短期计划。根据省爱国卫生运动委员会的决议，督促协调部门完成分担的工作任务。组织开展卫生健康知识宣传、健康教育、健康促进活动，普及科学卫生知识。承担健康施甸战略协调推进工作。承担《烟草控制框架公约》牵头履约工作。
（八）疾病预防控制股。规划指导监测预警体系建设和完善传染病疫情网络直报系统，建立疫情信息通报和共享机制，指导医疗机构落实疾病预防控制工作。组织开展传染病疫情监测、风险评估，提出预警决策和启动应急响应建议。承担传染病疫情应急相关工作，组织编制预案并开展演练，承担应急体系、能力及队伍建设工作，强化应急物资储备。按照国家检疫、监测传染病目录，拟订传染病相关公共卫生干预措施并组织实施，组织开展传染病防控效果评估。拟订并组织实施免疫规划，组织预防接种服务体系及其信息系统建设工作，组织开展疫苗针对传染病防控的免疫效果评估。指导开展寄生虫病与地方病防控工作。拟订全县学校卫生管理政策措施，并指导实施。拟订意外伤害相关预防措施。拟定慢性病防控管理政策规范并监督实施。承担推进心理健康和精神卫生工作。贯彻落实和监督执行职业病防治相关法律法规，监督实施职业卫生、放射卫生有关政策、标准。开展重点职业病监测、专项调查、职业健康风险评估和职业人群健康管理工作。组织协调传染病疫情应对工作，承担医疗卫生应急体系建设。组织食品安全风险监测评估，开展食品安全企业标准备案及食品安全标准跟踪评价，落实餐饮具集中消毒单位卫生监管工作。承担医疗机构疾病预防控制监督工作，组织对医疗机构开展疾病预防控制工作的督导、检查和考核，依法组织查处传染病防治重大违法行为，指导建立疾病预防控制监督员制度。
（九）防治艾滋病股。贯彻落实艾滋病防治有关法律法规及工作规范，健全相关工作机制，拟订艾滋病、性病和丙肝等性途径传播疾病防治政策措施及规划，组织开展政策宣讲、督导考核及效果评估。统筹调配防控资源，加强部门协作，督促协调相关单位履行防治艾滋病等工作职责。动员社会各方面力量积极参与防艾工作，指导和支持社会组织开展防艾工作。组织全县艾滋病防治规划编制和实施。
